水稻苗期根不同的颜色表示水稻根系活力情况，一般说来白根有劲、黄根保命、黑根生病、灰根要命。
(1)白根
白根一般都是新根或是老根的尖端部分，这些根因其分泌氧的能力强，能使根际周围的土壤呈氧化状态，形成一个氧化圈，将其周围的可溶性二价铁氧化成三价铁沉淀，而不聚集在根的表面，保持了根的白色。白根有很强的生理功能，生命活动和吸收能力都很强，所以说白根有劲。
(2)黄根
这是老根和根的基部所表现的特征。这些根因为老化，外皮层细胞壁增厚，泌氧能力下降，“氧化圈”缩小到贴近根表，三价铁沉淀在根上，成为黄褐色铁膜。这层铁膜有保护的作用，可防止有毒物质侵入根的内部，所以说黄根保命。
(3)黑根
在较长期淹水以后，由于土壤内氧化不足，有机质进行嫌气分解，产生硫化氢等一系列有毒物质，当硫化氢与二价铁相结合时，便产生硫化铁(黑色)沉淀在根表。这种根的生理机能已大大衰退，所以说黑根生病。
(4)灰白色的腐根
土壤中的二价铁存在，可以及时消除硫化氢的毒害作用，对水稻生长是有益的。若土壤内缺少铁元素，硫化氢得不到消除，它对根的毒害作用是很大的。它能抑制根系的呼吸作用和吸收功能，使稻根中毒死亡。硫化氢中毒的症状是拔起稻苗进行观察，如果根系表面白色透明，呈灰色水渍状，有一股臭蛋气味，便说明是硫化氢中毒，这种根已完全丧失生理功能。
