由于坚决拒绝按特朗普的要求进行整改，哈佛大学的一个重要资金来源陷入了危机。美国国土安全部于5月22日宣布暂停哈佛大学招收国际学生的资格。部长诺姆在致哈佛大学的信中表示，哈佛大学的学生和交流访问者项目认证即日起被撤销。此举意味着哈佛大学在2025-2026学年不得招收任何持F类或J类非移民身份的外籍学生。现有持这两类身份的学生必须转学至其他高校，否则将无法维持其非移民身份。
哈佛大学对此回应称，国土安全部的举动违法，并表示将全力维护招收来自140多个国家的国际学生和学者的能力。后续哈佛可能会再度发起法律挑战。
特朗普政府此举意在切断哈佛大学重要的财务来源。目前约有6800名国际学生就读于哈佛大学，约占学生总数的27%，另外还有约3170名海外访问学者在此深造。最新学年的学费为59320美元，包含食宿费用的总支出可能高达87000美元。作为私立大学，哈佛大学2023年的年度预算高达61亿美元，主要来源于慈善捐赠与基金收益（43%）、学费与科研收入（39%）以及联邦政府拨款（11%），后者主要用于基础建设和特定研究领域。
充足的经费使哈佛大学在生命科学、自然科学、法学、医学等多个领域拥有世界级的学术影响力。未来超过一成的经费受到冲击，势必影响其对上述领域的投入。
特朗普誓言要对被视为“自由主义温床”的大学采取行动，试图迫使它们遵守他的政治议程。今年3月，联邦教育部、卫生与公共服务部和总务管理局联合要求哈佛大学进行10点整改，包括对所有教职员工进行学术剽窃检查、向联邦政府提供所有录取学生数据、禁止校园抗议活动参与者戴面罩、立即关闭包容性项目、打击反犹太主义等。否则将审查87亿美元拨款及2.556亿美元的项目合同。
